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Per la sottosezione 1898-1927 (anno in cui Brembate di Sopra viene accorpato al comune di Ponte S. Pietro) la documentazione è stata ricollocata seguendo la scansione dettata dalla circolare del Ministero dell'Interno n. 17100/2 del 1° marzo 1897, "Istruzioni per la tenuta del protocollo e dell'archivio per gli uffici comunali oltre al titolario per classificare gli atti dei Comuni". Come testimoniano anche i registri di protocollo non è mai stata utilizzata alcuna classificazione più specifica di quella della Categoria (vale a dire non sono mai state utilizzate le Classi). Le uniche sotto partizioni riscontrate riguardano le serie di deliberazioni del Consiglio Comunale (collocate in Categoria I), le liste degli eleggibili all'Ufficio di Conciliatore e Vice Conciliatore, e dei giurati per la Corte d'Assise e d'Appello (collocate in Categoria V); le liste di leva, i bollettari dei soccorsi pagati, e i fascicoli personali dei militari del 1915-1918 (collocate nella Categoria VIII); i collaudi delle strade e la costruzione dell'acquedotto (1906-1915) collocate sempre come sottovoci nella Categoria X. La parte residua dell'archivio storico (documentazione fino al 1965) non ha soluzione di continuità con l'archivio di deposito.