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Nella sezione cosiddetta ottocentesca è riunita la documentazione classificata secondo l'inventario precedente con titoli per materia. Nella sezione in oggetto è compreso sotto il titolo "Beni comunali istrumenti antichi" tutto ciò che rimane dell'archivio di Antico Regime del comune di S. Pellegrino Terme. Scarsa, nell'ambito della partizione identificata, è la documentazione del periodo Lombardo Veneto (1815-1859). Gli estremi cronologici della sezione, fatta eccezione per la documentazione più antica riguardano pertanto documentazione postunitaria. La sezione si chiude con il 1897. Dal 1898 la documentazione sarà protocollata, classificata e archiviata sulla base della Circolare del Ministero dell'interno 1 marzo 1897, 1700-2, Istruzioni per la tenuta del protocollo e dell'archivio per gli uffici comunali.